(1) V čele ústavu je ředitel jmenovaný ministrem zemědělství.
(2) K zajištění správného provádění výkonnostních zkoušek koní na dostihové dráze (dostihů) se zřídí u obou ústavů osmičlenné kolegium rozhodčích, jehož členy jmenuje ministerstvo zemědělství. Předseda kolegia rozhodčích a člen, který vykonává funkci hlavního cílového rozhodčího, nesmějí být jmenováni z řad zaměstnanců ústavu. Úkoly kolegia rozhodčích stanoví ministerstvo zemědělství.
(3) Zatížení koní v handicapech určuje handicaper příslušného ústavu. Jmenuje ho ministerstvo zemědělství; nesmí být z řad zaměstnanců ústavů.
(4) Podrobnosti o organisaci ústavů stanoví organisační řád, který vydá ministerstvo zemědělství.