(2) Účelové finanční prostředky mohou být použity na podporu projektů až do 100 % celkových uznaných nákladů u výzkumu a vývoje pro potřeby státu, u badatelského výzkumu a u cíleného výzkumu s výjimkou průmyslového výzkumu; u průmyslového výzkumu nejvýše do 50 % celkových uznaných nákladů a u vývoje do 25% celkových uznaných nákladů s tím, že

a) u společných projektů právnických osob zabývajících se podnikáním a právnických osob institucionálně podporovaných z veřejných zdrojů se přípustná výše podpory formou dotace stanoví jak z účelových finančních prostředků na podporu projektu, tak i z odpovídající části institucionální podpory,

b) maximálně přípustná výše podpory průmyslového výzkumu nebo vývoje ze státního rozpočtu může být zvýšena

1. o 10 % celkových uznaných nákladů, jestliže je účelové financování určeno pro malý nebo střední podnik,

2. o 10% celkových uznaných nákladů, jestliže se výzkum týká regionu s mimořádně nízkou životní úrovní nebo s velmi vysokou nezaměstnaností,

3. o 5 % celkových uznaných nákladů, jestliže se výzkum týká vládou podporovaného ekonomického odvětví nebo regionu, pokud nepovede ke změně podmínek obchodu (volného trhu),

4. o 15 % celkových uznaných nákladů, jestliže projekt přispívá k dosažení cílů některého z dílčích programů nebo projektů Rámcového programu výzkumu a vývoje Evropské unie,

c) celková výše podpory výzkumu a vývoje ze státního rozpočtu nesmí být vyšší než 75 % celkových uznaných nákladů u průmyslového výzkumu a nejvíce 50 % celkových uznaných nákladů u vývoje,

d) výše účelového financování může být dále omezena na základě hodnocení slučitelnosti s mezinárodními závazky České republiky v souladu se zvláštním právním předpisem.⁴)