a) přirozená lesní společenstva horských smrčin, kyselých bučin, ledovcových karů, sutí a balvanitých polí a stojatých oligotrofních vod ledovcových jezer,
b) vzácné a ohrožené druhy rostlin a živočichů, zejména populace kriticky ohroženého druhu rostliny šídlatky jezerní (Isoëtes lacustris), včetně jejího biotopu,
c) typy přírodních stanovišť a druhy, pro které byla jinými právními předpisy2) vyhlášena Evropsky významná lokalita Šumava a které se nacházejí na území národní přírodní rezervace.