(1) Příjmy Fondu tvoří zejména
a) poplatky za vypouštění odpadních vod do vod povrchových,2)
b) poplatky za vypouštění škodlivých látek do ovzduší,3)
c) poplatky podle zákona o odpadech,4)
d) odvody za odnětí půdy ze zemědělského půdního fondu ve výši stanovené zákonem o ochraně zemědělského půdního fondu,
e) poplatky za skutečný odběr podzemních vod6) ve výši 50 % jejich celkového objemu,
f) úhrady odváděné do státního rozpočtu za vydobyté nerosty,
g) pokuty uložené orgány správce Fondu a Českou inspekcí životního prostředí7) za porušení předpisů a opatření k ochraně životního prostředí,
h) peněžní příjmy z postihu žadatelů za neoprávněné použití nebo zadržení prostředků Fondu,
i) dotace ze státního rozpočtu,
j) podíly na výnosu daní,
k) úvěry od právnických osob,
l) příspěvky od tuzemských a zahraničních právnických a fyzických osob,
m) další příjmy stanovené obecně závaznými právními předpisy v jednotlivých úsecích životního prostředí.