2.3.3. Do konce roku 2007 v působnosti Ministerstva zemědělství a Ministerstva životního prostředí, vymezit na podkladě koncepčních studií návrh konkrétních opatření v jednotlivých prioritních oblastech:
Tato opatření věcně zaměřit v souladu s cíli Operačního programu Životní prostředí na období 2007 až 2013, programu Rozvoje venkova na období 2007 až 2013 a programu Prevence před povodněmi II. etapa na období 2007 až 2012. Po kladném posouzení je promítnout do plánů oblastí povodí, promítnout do územních plánů a zahájit jejich investorskou přípravu.

a) V hlavním povodí Labe
– Komplex protipovodňových opatření na Lužnici a Nežárce
– Komplex protipovodňových opatření v povodí dolní Vltavy v úseku Štěchovice - Mělník
– Komplex protipovodňových opatření v území středního Labe v úseku Kolín - Mělník
– Protipovodňová opatření v údolí vodního toku Dědiny
– Komplex protipovodňových opatření v území dolního Labe v úseku Štětí - Křešice - Hřensko
– Ochrana České Lípy a obcí v záplavovém území Ploučnice, včetně protipovodňových opatření v povodí Svitávky
– Komplex protipovodňových opatření a ochrana obcí v území soutoku Ohře a Labe.

b) V hlavní povodí Odry
– Protipovodňová opatření k ochraně obcí na horní Opavě
– Protipovodňová opatření v Liberecko-Jablonecké aglomeraci.

c) V hlavním povodí Moravy
– Protipovodňová opatření v území Olomouce
– Protipovodňová opatření v území Litovle
– Protipovodňová opatření v území Uherského Hradiště a Starého Města
– Komplex protipovodňových opatření na dolní Bečvě a soutoku s Moravou
– Rekonstrukce suchých nádrží (poldrů) a řízených inundací pod vodním dílem Nové Mlýny
– Zvýšení retence na soutoku Moravy a Dyje
– Řízené inundace v území Kroměříže
– Řízené inundace v území Mohelnické brázdy.