4.2 Probitová metoda
Podrobná statistická analýza lineární regresní závislosti transformované odpovědi na logaritmu dávky je velmi pracná. Dá se provést iteračně metodou maximální věrohodnosti. K dispozici jsou však počítačové programy. Tato analýza je popsána v mnohých učebnicích.
Za předpokladu, že je dostatečný počet odpovědí různých od nulových a stoprocentních, a za předpokladu, že není významná odchylka od linearity, dávají dostatečně přesné výsledky často již i prvé dva kroky probitové metody. Následující metoda se týká porovnání jednoho přípravku se standardem. Při porovnání více přípravků se standardem je nutná porada s biometrem. Výpočet se dá provést pomocí tabulek a kalkulačky. Kroky 1 až 5 poskytují první aproximaci, kroky 6 až 9 druhou. Kroky 10 až 11 obsahují test linearity a rovnoběžnosti závislosti probitu na logaritmu dávky pro standard a testovaný přípravek a v kroku 12 je počítán logaritmus účinnosti M’ a jeho meze spolehlivosti.
Stejná posloupnost kroků se dá použít k vytvoření počítačového programu s využitím modifikací popsaných na konci každého z následujících kroků.
Probit je jednoduchá lineární funkce standardní normální veličiny T. Počítačový program se dá sestavit s využitím následujících proměnných:
První algoritmus odhaduje T z hodnot P a druhý umožňuje získat odhady D a P odpovídající hodnotě T. Veličiny T, D a P se odhadují pro každou dávkovou skupinu i (Ti, Di a Pi).
Postup
Algoritmus 4.2-I
Algoritmus požaduje jako vstup pravděpodobnost Pi a počítá Ti aproximované pomocí:
kde:
| a0 = 2,515517 | b0 = 1,0 |
| a1 = 0,802853 | b1 = 1,1432788 |
| a2 = 0,010328 | b2 = 20,189269 |
| b3 = 0,001308 |
Je-li P > 0,5, dosadí se ve vzorci pro w za P hodnota (1 - P) a výsledné Ti se vynásobí -1.
Tento a následující algoritmus jsou převzaty z příručky Abramowitze a Steguna14).
Algoritmus 4.2-II
Algoritmus požaduje Ti jako vstup a počítá hustotu D a aproximaci P pomocí následujících formulí:
kde:
a1 = 0,3193815
a2 = -0,3565638
a3 = 1,781478
a4 = -1,821256
a5 = 1,330724
Je-li Ti < 0, dosadí se ve vzorci pro w za Ti hodnota -Ti a místo vypočtené hodnoty P, se vezme 1 – Pi.
Tab. 4.2-I Výsledné veličiny
| Přípravek | X | n | r | p | Ye | YI | w | nw | y | nwy | nwX | nwXy | YII |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| (1) | (2) | (3) | (4) | (5) | (6) | (7) | (8) | (9) | (10) | (11) | (12) | (13) | (14) |
Tab. 4.2-II Probity odpovídající procentům P
| p | 0 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 0 | — | 2,67 | 2,95 | 3,12 | 3,25 | 3,36 | 3,45 | 3,52 | 3,59 | 3,66 |
| 10 | 3,72 | 3,77 | 3,82 | 3,87 | 3,92 | 3,96 | 4,01 | 4,05 | 4,08 | 4,12 |
| 20 | 4,16 | 4,19 | 4,23 | 4,26 | 4,29 | 4,33 | 4,36 | 4,39 | 4,42 | 4,45 |
| 30 | 4,48 | 4,50 | 4,53 | 4,56 | 4,59 | 4,61 | 4,64 | 4,67 | 4,69 | 4,72 |
| 40 | 4,75 | 4,77 | 4,80 | 4,82 | 4,85 | 4,87 | 4,90 | 4,92 | 4,95 | 4,97 |
| 50 | 5,00 | 5,03 | 5,05 | 5,08 | 5,10 | 5,13 | 5,15 | 5,18 | 5,20 | 5,23 |
| 60 | 5,25 | 5,28 | 5,31 | 5,33 | 5,36 | 5,39 | 5,41 | 5,44 | 5,47 | 5,50 |
| 70 | 5,52 | 5,55 | 5,58 | 5,61 | 5,64 | 5,67 | 5,71 | 5,74 | 5,77 | 5,81 |
| 80 | 5,84 | 5,88 | 5,92 | 5,95 | 5,99 | 6,04 | 6,08 | 6,13 | 6,18 | 6,23 |
| 90 | 6,28 | 6,34 | 6,41 | 6,48 | 6,55 | 6,64 | 6,75 | 6,88 | 7,05 | 7,33 |
| 0,0 | 0,1 | 0,2 | 0,3 | 0,4 | 0,5 | 0,6 | 0,7 | 0,8 | 0,9 | |
| 99 | 7,33 | 7,37 | 7,41 | 7,46 | 7,51 | 7,58 | 7,65 | 7,75 | 7,88 | 8,09 |
Tab. 4.2-III Minimální a maximální pracovní probity, rozsah a váhové koeficienty
| Empirický probit | Minimální pracovní probit | Rozsah | Maximální pracovní probit | Empirický probit | Váhy |
|---|---|---|---|---|---|
| Ye | Y0 | A | Y1 | Ye | w |
| 1,1 | 0,8579 | 5034,0 | 9,1421 | 8,9 | 0,00082 |
| 1,2 | 0,9522 | 3425,0 | 9,0478 | 8,8 | 0,00118 |
| 1,3 | 1,0462 | 2354,0 | 8,9538 | 8,7 | 0,00167 |
| 1,4 | 1,1400 | 1634,0 | 8,8600 | 8,6 | 0,00235 |
| 1,5 | 1,2334 | 1146,0 | 8,7666 | 8,5 | 0,00327 |
| 1,6 | 1,3266 | 811,5 | 8,6734 | 8,4 | 0,00451 |
| 1,7 | 1,4194 | 580,5 | 8,5806 | 8,3 | 0,00614 |
| 1,8 | 1,5118 | 419,4 | 8,4882 | 8,2 | 0,00828 |
| 1,9 | 1,6038 | 306,1 | 8,3962 | 8,1 | 0,01104 |
| 2,0 | 1,6954 | 225,6 | 8,3046 | 8,0 | 0,01457 |
| 2,1 | 1,7866 | 168,00 | 8,2134 | 7,9 | 0,01903 |
| 2,2 | 1,8771 | 126,34 | 8,1228 | 7,8 | 0,02458 |
| 2,3 | 1,9673 | 95,96 | 8,0327 | 7,7 | 0,03143 |
| 2,4 | 2,0568 | 73,62 | 7,9432 | 7,6 | 0,03977 |
| 2,5 | 2,1457 | 57,05 | 7,8543 | 7,5 | 0,04979 |
| 2,6 | 2,2339 | 44,654 | 7,7661 | 7,4 | 0,06168 |
| 2,7 | 2,3214 | 35,302 | 7,6786 | 7,3 | 0,07564 |
| 2,8 | 2,4081 | 28,189 | 7,5919 | 7,2 | 0,09179 |
| 2,9 | 2,4938 | 22,736 | 7,5062 | 7,1 | 0,11026 |
| 3,0 | 2,5786 | 18,522 | 7,4214 | 7,0 | 0,13112 |
| 3,1 | 2,6624 | 15,2402 | 7,3376 | 6,9 | 0,15436 |
| 3,2 | 2,7449 | 12,6662 | 7,2551 | 6,8 | 0,17994 |
| 3,3 | 2,8261 | 10,6327 | 7,17316 | 6,7 | 0,20774 |
| 3,4 | 2,9060 | 9,0154 | 7,0940 | 6,6 | 0,23753 |
| 3,5 | 2,9842 | 7,7210 | 7,0158 | 6,5 | 0,26907 |
| 3,6 | 3,0606 | 6,6788 | 6,9394 | 6,4 | 0,30199 |
| 3,7 | 3,1351 | 5,8354 | 6,8649 | 6,3 | 0,33589 |
| 3,8 | 3,2074 | 5,1497 | 6,7926 | 6,2 | 0,37031 |
| 3,9 | 3,2773 | 4,5903 | 6,7227 | 6,1 | 0,40474 |
| 4,0 | 3,3443 | 4,1327 | 6,6557 | 6,0 | 0,43863 |
| 4,1 | 3,4083 | 3,7582 | 6,5917 | 5,9 | 0,47144 |
| 4,2 | 3,4687 | 3,4519 | 6,5313 | 5,8 | 0,50160 |
| 4,3 | 3,5251 | 3,2025 | 6,4749 | 5,7 | 0,53159 |
| 4,4 | 3,5770 | 3,0010 | 6,4230 | 5,6 | 0,55788 |
| 4,5 | 3,6236 | 2,8404 | 6,3764 | 5,5 | 0,58099 |
| 4,6 | 3,6643 | 2,7154 | 6,3357 | 5,4 | 0,60052 |
| 4,7 | 3,6982 | 2,6220 | 6,3018 | 5,3 | 0,61609 |
| 4,8 | 3,7241 | 2,5573 | 6,2759 | 5,2 | 0,62742 |
| 4,9 | 3,7407 | 2,5192 | 6,2593 | 5,1 | 0,63431 |
| 5,0 | 3,7467 | 2,5066 | 6,2533 | 5,0 | 0,63662 |
| 5,1 | 3,7401 | 2,5192 | 6,2599 | 4,9 | 0,63431 |
| 5,2 | 3,7186 | 2,5573 | 6,2814 | 4,8 | 0,62742 |
| 5,3 | 3,6798 | 2,6220 | 6,3202 | 4,7 | 0,61609 |
| 5,4 | 3,6203 | 2,7154 | 6,3797 | 4,6 | 0,60052 |
| 5,5 | 3,5360 | 2,8404 | 6,4640 | 4,5 | 0,58099 |
| 5,6 | 3,4220 | 3,0010 | 6,5780 | 4,4 | 0,55788 |
| 5,7 | 3,2724 | 3,2025 | 6,7276 | 4,3 | 0,53159 |
| 5,8 | 3,0794 | 3,4519 | 6,9206 | 4,2 | 0,50260 |
| 5,9 | 2,8335 | 3,7582 | 7,1665 | 4,1 | 0,47144 |
| 6,0 | 2,5230 | 4,1327 | 7,4770 | 4,0 | 0,43863 |
| 6,1 | 2,1324 | 4,5903 | 7,8676 | 3,9 | 0,40474 |
| 6,2 | 1,6429 | 5,1497 | 8,3571 | 3,8 | 0,37031 |
| 6,3 | 1,0295 | 5,8354 | 8,9705 | 3,7 | 0,33589 |
| 6,4 | 0,2606 | 6,6788 | 9,7394 | 3,6 | 0,30199 |
| 6,5 | -0,7052 | 7,7210 | 10,7052 | 3,5 | 0,26907 |
1. standardizovaná normální veličina T;
1. Sestavení tabulek výsledků
Použije se tabulka 4.2-I pro zapsání každé skupiny ošetření do sloupců označených čísly:
Počítačový program může obsahovat převod dávek na jejich logaritmus X.
1. přípravek (standardní nebo testovaný),
2. X je logaritmus dávky (nebo jeho jednoduchý kód),
3. počet testovaných jedinců n při této dávce,
4. počet reagujících jedinců r při této dávce.
2. hustota D odpovídající hodnotě standardizované normální veličiny T, pro T = Ti je D = Di;
2. Výpočet podílu (procenta) reagujících v dávkové skupině
Výpočet empirického podílu p = r/n a jeho zapsání do sloupce 5. Obvykle stačí dvě desetinná místa. Ošetřené skupiny s p = 0 a p = 1 se vyloučí.
3. pravděpodobnost P, že veličina T má hodnotu nejvýše Ti (T ≤ Ti).
3. Empirické probity
Z tabulky 4.2-II se získají pro každou skupinu ošetření empirické probity Ye odpovídající empirickému podílu p (vyjádřenému v procentech) a zapíší se do sloupce 6.
Pro výpočet empirických probitu se může použít algoritmus 4.2-I k vyjádření odpovědi tvaru Ye = T + 5 (tím se odstraní záporné odpovědi).
4. Nevážená lineární regrese odpovědi na logaritmu dávky
Počáteční odhad tohoto vztahu se může získat buď graficky (viz obr. 4.3-I), nebo početně. Při použití první metody se nejprve sestrojí bodový graf hodnot Ye v závislosti na X a získanými body se zvlášť pro standardní a testovaný přípravek "od oka" proloží rovnoběžné přímky s větším důrazem na body s empirickými probity mezi 4,0 a 6,0 než na body mimo tyto meze.
Druhý způsob spočívá v proložení přímek metodou nevážené lineární regrese. Vypočtou se:
(dvojitě jsou označeny součty pro všechny skupiny ošetřené standardním nebo zkoušeným přípravkem dohromady),
(Parametr se vypočte zvlášť pro standardní a zkoušený přípravek.)
Počítačový program používá k získání regresních parametrů a a b rovněž tyto vzorce.
5. První aproximace očekávaných probitů
Při použití grafické metody se na přímkách pro obě ošetření na grafu odečtou hodnoty F a zapíší se do sloupce 7.
Při použití početní metody poskytuje počáteční aproximaci Yi ke každé hodnotě X zvlášť pro standardní a testovaný přípravek rovnice:
Stejná rovnice se užívá i v počítačovém programu.
6. Váhové koeficienty
Pro každé YI se v tabulce 4.2.-III najde hodnota váhového koeficientu w a zapíše se do sloupce (8), součin nw pak do sloupce (9). Všechny hodnoty nw se udávají na stejný počet desetinných míst. Obvykle stačí jedno desetinné místo.
V počítačovém programu se k výpočtu váhových koeficientů použije algoritmus 4.2-II (viz dále): k vstupním hodnotám které odpovídají hodnotám Yi, se vypočtou hodnoty Pi a Di. Z nich se vypočtou váhy wi pro každou hodnotu Yi podle vzorce:
7. Pracovní probity
Pomocí tabulky 4.2.-III a následujících vzorců se vypočtou pracovní probity yi pro všechny skupiny i:
Y0, Y1 a A značí minimální probit, maximální probit a rozsah, P je pravděpodobnost příslušná k první aproximaci empirického probitu YI Pracovní probity, se zapíše do sloupce (10) v tabulce 4.2-I. Obvykle stačí dvě desetinná místa. Jejich počet by měl být stejný pro všechny ošetřené skupiny.
Pro počítačový program jsou vhodné následující dva vzorce pro pracovní probity yi odpovídající hodnotám YI:
Hodnota Di odpovídá empirickému podílu pi (jakožto pravděpodobnosti).
8. Vážené průměry, součty čtverců a součty součinů
Pro všechna ošetření se vytvoří součiny nwy, nwX a nwXy a zapíší se do sloupců (11), (12) a (13). Zvlášť pro standard a přípravek se vypočtou součty sloupců (9), (11) a (12) a z nich vážené průměry:
Dále se vypočtou součiny nwX2, nwy2 a nwXy, z nich vážené součty čtverců 2X a2y a součty součinů Xy, opět zvlášť pro standard a testovaný přípravek. S jejich pomocí se vypočtou veličiny Sxx, SXy a Syy podle těchto vzorců:
Stejné vzorce se použijí i v počítačovém programu.
9. Druhá a další aproximace probitu
Pro druhou (lineární) aproximaci probitu se nejprve vypočte společný parametr sklonu b2 podle vzorce:
(Sčítají se hodnoty pro standardní a zkoušený přípravek.)
Tato hodnota se použije k výpočtu parametru a2 zvlášť pro každý z přípravků:
Tak se získá druhá aproximace YII pro standard a přípravek odděleně ve tvaru dvou regresních přímek:
Podle těchto rovnic se vypočtou hodnoty YII pro všechny skupiny ošetřované oběma přípravky a porovnají se s odpovídajícími hodnotami YI. Jsou-li alespoň některé rozdíly mezi nimi velké, např. větší než 0,1 při počítání na jedno desetinné místo, vypočte se další aproximace zopakováním kroků 6 až 9, přičemž se všechny hodnoty YI nahradí příslušnými hodnotami YII. Stejně se postupuje i tehdy, jeví-li uvedené rozdíly závislost na dávce.
V počítačovém programu se vypočtou pro všechny ošetřené skupiny čtverce rozdílů YII - YI a jejich součet. Je-li tento součet čtverců větší než například 10-7, nahradí se všechny hodnoty YI příslušnými hodnotami YII a opakují se kroky 6 až 9.
10. Test odchylky od linearity
Ve zkoušce alespoň se třemi dávkami pro každý přípravek se dá testovat významnost odchylky od linearity pomocí statistiky:
s f = (k - 4) stupni volnosti. Odpovídající kritické hodnoty jsou v tabulce 6.2. Při významné hodnotě χ2 je nutno konzultovat vyhodnocení zkoušky se statistikem. Počítačový program může poskytnout obsluze vypočtený χ2 a příslušné stupně volnosti bez dalšího komentáře. Jiná možnost je vytvořit soubor kritických hodnot z podprogramu, který vypočte aproximaci pravděpodobnosti překročení hodnoty χ2 Vhodné vzorce k těmto výpočtům jsou v knize Abramowitz a Stegun13).
11. Test odchylky od rovnoběžnosti
Pokud se neprokázala významná odchylka od linearity, pak se testuje ještě rovnoběžnost pomocí statistiky:
s jedním stupněm volnosti.
12. Výpočet účinnosti a jejích mezí spolehlivosti
Při nevýznamné odchylce od rovnoběžnosti je možno počítat logaritmus účinnosti M´podle vzorce:
Účinnost je pak antilogaritmus M´ (exp(M´)). Meze spolehlivosti se vypočtou jako antilogaritmy hodnot:
kde
Je patrná analogie těchto výrazů s výrazem 3.2.5-4 pro výpočet mezí spolehlivosti ve zkouškách účinnosti s kvantitativní odpovědí. Součet čtverců pro regresi v kapitole 3.2.3 se dá psát ve tvaru:
Při probitové transformaci je reziduální rozptyl odpovědí roven jedné. Kritická hodnota t s ∞ stupni volnosti se najde v tabulce 6.1.
Pro nekonečný počet stupňů volnosti má veličina t standardní normální rozdělení, takže počítačový program může počítat požadovanou hodnotu t algoritmem 4.2-I s pravděpodobností P odpovídající polovině požadované hladiny významnosti.