4.2. Reakční směs PCR
a) Protokol PCR specifický pro biovar 1/2
| Reagencie | Množství v reakci | Konečná koncentrace |
|---|---|---|
| Sterilní UPW | 12,925 µl | |
| 10x pufr PCR(1) | 2,5 µl | 1x (1,5 mM MgCl2) |
| BSA (frakce V) (10 %) | 0,25 µl | 0,1 % |
| Směs dNTP (20mM) | 0,125 µl | 0,1 mM |
| Primer Rs-1-F (10 µM) | 2,0 µl | 0,8 µM |
| Primer Rs-1-R (10 µM) | 2,0 µl | 0,8 µM |
| Taq polymeráza (5U/µl)(1) | 0,2 µl | 1,0 U |
| Množství vzorku | 5,0 µl | |
| Celkové množství | 25,0 µl | |
| (1) Metoda byla validována použitím Taq polymerázy Perkin Elmer (AmpliTaq) a Gibco BRL. | ||
b) Protokol PCR specifický pro Biovar 3/4/5
| Reagencie | Množství v reakci | Konečná koncentrace |
|---|---|---|
| Sterilní UPW | 14,925 µl | |
| 10x pufr PCR (1) | 2,5 µl | 1x (1,5 mM MgCl2) |
| BSA (frakce V) (10 %) | 0,25 µl | 0,1 % |
| Směs dNTP (20mM) | 0,125 µl | 0,1 mM |
| Primer Rs-1-F (10 µM) | 1,0 µl | 0,4 µM |
| Primer Rs-3-R (10 µM) | 1,0 µl | 0,4 µM |
| Taq polymeráza (5U/µl) (1) | 0,2 µl | 1,0 U |
| Množství vzorku | 5,0 µl | |
| Celkové množství | 25,0 µl | |
| (1)Metoda byla validována použitím Taq polymerázy Perkin Elmer (AmpliTaq) a Gibco BRL. | ||