4.2. Reakční směs PCR

a) Protokol PCR specifický pro biovar 1/2

ReagencieMnožství v reakciKonečná koncentrace
Sterilní UPW12,925 µl
10x pufr PCR(1)2,5 µl1x (1,5 mM MgCl2)
BSA (frakce V) (10 %)0,25 µl0,1 %
Směs dNTP (20mM)0,125 µl0,1 mM
Primer Rs-1-F (10 µM)2,0 µl0,8 µM
Primer Rs-1-R (10 µM)2,0 µl0,8 µM
Taq polymeráza (5U/µl)(1)0,2 µl1,0 U
Množství vzorku5,0 µl
Celkové množství25,0 µl
(1) Metoda byla validována použitím Taq polymerázy Perkin Elmer (AmpliTaq) a Gibco BRL.

b) Protokol PCR specifický pro Biovar 3/4/5

ReagencieMnožství v reakciKonečná koncentrace
Sterilní UPW14,925 µl
10x pufr PCR (1)2,5 µl1x (1,5 mM MgCl2)
BSA (frakce V) (10 %)0,25 µl0,1 %
Směs dNTP (20mM)0,125 µl0,1 mM
Primer Rs-1-F (10 µM)1,0 µl0,4 µM
Primer Rs-3-R (10 µM)1,0 µl0,4 µM
Taq polymeráza (5U/µl) (1)0,2 µl1,0 U
Množství vzorku5,0 µl
Celkové množství25,0 µl
(1)Metoda byla validována použitím Taq polymerázy Perkin Elmer (AmpliTaq) a Gibco BRL.